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-Coexistence de trois types d'institutions indépendantes les unes des autres (universités, grandes écoles et grands organismes de recherche), juxtaposition de statuts du personnel rigides et peu propices à la mobilité, hétérogénéité des règles de gestion financière et administrative : l'observation de ces phénomènes a conduit la Cour des comptes et les Chambres régionales des comptes à engager une enquête sur la gestion des activités de recherche dans les universités. Le rapport analyse tout d'abord la profonde mutation de la recherche publique en France à travers l'expansion de la recherche dans les universités. Il étudie ensuite le rôle des universités en matière de recherche (formation des futurs chercheurs, gestion des activités des unités de recherche). Il se penche enfin sur le fonctionnement des laboratoires (profonde diversité des situations, obstacles à la mise en place de structures et de modes de gestion efficaces). Pour chacune des parties du rapport sont formulées des recommandations visant à assurer le meilleur rendement possible des moyens consacrés à la recherche.